新生命宣道堂是由教會理事會和長牧團及各堂執事會合作管理。
教會理事會負責整教會的方向和跨堂會的所有事務，如法律事務，物業購買及管理，財務，人力資源等。
長牧團負責教會的靈命成長，方向及異象。
各堂執事會根據教會的整體方針和異象負責該堂的方向, 事工管理和運作。
下圖為新生命宣道堂組織架構
